A finales de diciembre, la junta separó a Moreno de la plantilla y lo expedientó, pues se unió al posicionamiento de los jugadores, que llevaban tiempo sin cobrar. La filosofía no está plasmada en los estatutos del club para evitar problemas legales, con lo que puede estar sujeta a posibles variaciones según las circunstancias, o las preferencias de la junta directiva en vigor. Primero llegó la dimisión como presidente de Luis Cuervas, que fue sustituido de forma interina por José María del Nido. El Sevilla comenzó la temporada perdiendo en un mal partido la Supercopa de Europa ante el Real Madrid por 2-0. A pesar de ello, el equipo acabó quinto en una Liga de récord (76 puntos, a sólo dos del tercero), y revalidó el título de campeón de la Europa League siendo además el primero que consigue el bicampeonato dos veces consecutivas (2006-2007 y 2014-2015), siendo esta la tercera vez en la historia de la competición ya que anteriormente el Real Madrid lo hizo en los años 1985-1986 y convirtiéndose en el equipo más laureado de dicha competición con 4 títulos. Almería, y además, el club indálico también disputaba sus encuentros en el histórico Estadio Municipal Juan Rojas, hechos que ponen de manifiesto que si bien no hubo una fusión, sí que hubo una «unión» del fútbol almeriense.
Además, este se convirtió en el fichaje más caro realizado en toda la historia de la Primera División de Portugal. Almería realizó el fichaje más caro de su historia y de la historia de la Segunda División de España, logrando birlarle el traspaso de Arvin Appiah el Manchester United, pagando 8,8 millones de euros al Nottingham Forest. El 17 de agosto de 2019, el VAR fue usado por primera vez en la historia de la Segunda División de España. La siguiente temporada, la 2001-02 trajo consigo la alegría de un nuevo ascenso a la Segunda División de España, nuevamente con una plantilla llena de jugadores almerienses y de almeriensistas que a la postre pasarían a la historia de este club, ya que este ascenso supuso los cimientos de los años venideros. En la temporada de su debut en la Primera División de España (2007/08) logró su mejor resultado histórico en Primera División (8.º), logrando acabar en puestos de clasificación a la Copa Intertoto de la UEFA, que finalmente no podría disputar al no haber inscrito el expresidente Alfonso García Gabarrón al equipo en dicho torneo. La tercera temporada consecutiva en la Segunda División de España supone la consolidación en la categoría, aunque no de manera muy holgada, pero que posibilita que la campaña siguiente se produzca un salto de nivel y que el equipo ocupe los puestos altos de la clasificación con posibilidades de ascenso hasta casi el final de la liga.
En la temporada 2004-05, cabe mencionar un hecho simbólico dentro del seno almeriensista con el mítico jugador rojiblanco Cervián como protagonista de una curiosa anécdota sucedida durante el encuentro de Segunda División que enfrentó a la U.D. Dicho avanzado sistema es utilizado en la actualidad en diferentes deportes por algunos de los equipos más importantes y prestigiosos del mundo, como por ejemplo, el Liverpool FC o Los Angeles Lakers entre otros. El usuario puede familiarizarse con datos como el número de victorias, derrotas y promedios. No obstante, cabe mencionar que este hecho fue explicado a la sociedad almeriense como una fusión, pero que sin embargo no lo fue en absoluto, ya que el Club Polideportivo Almería volvió a la competición en el año 2003 y posee un número federativo diferente al de la U.D. El purgatorio dura tan solo una temporada y en la campaña 78/79 vuelven a Primera División, categoría en la que se afianzan a lo largo de los años ochenta con jugadores como Rincón, Yánez, Zafra, López Ufarte o el gran Rafa Gordillo. La elección del lugar de la portería al cual disparar es un tema controvertido y depende de cuántos jugadores estén cubriéndola. Nacho González, periodista especializado en fútbol inglés de ‘La Media Inglesa’ y DAZN, ha dejado en ‘La Pizarra de Quintana’ su predicción sobre un Grupo B. Inglaterra es el cabeza de cartel del cuarteto que completan Estados Unidos, Gales e Irán.
Su equipo filial, llamado Unión Deportiva Almería B, fue fundado en el año 1997, y en la actualidad compite en el Grupo IX de la Tercera División de España. El club también cuenta con una sección femenina, llamada Unión Deportiva Almería Femenino, la cual fue fundada en el año 2018 y en la actualidad compite en el Grupo IV de la Primera Nacional Femenina de España. Eventualmente, su padre se mudaría permanentemente en 2018. Sin embargo, no tardó en forjar relaciones en la cancha, como parte de un equipo juvenil que incluía al japonés Takefusa Kubo y el español Eric Garcia, que también forman parte de sus respetivos seleccionados mundialistas en Qatar. Las llamadas metas, también conocidas como porterías o arcos, constan de dos postes verticales (conocidos como palos o verticales) de 2,44 metros de alto ubicados a 7,32 metros de separación y sobre el centro de cada línea de meta. Almería se encuentran en tres clubes ampliamente conocidos en Almería; el C.D. Almería Genuine, siendo uno de los únicos 30 clubes de España con representación en dicha competición. Al comienzo, el Almería jugó durante tres temporadas consecutivas en la Regional Preferente de Almería hasta que logró subir a Tercera División en la temporada 1991-92. Tras el ascenso logra ascender nuevamente en la temporada 1992-93 a Segunda B, consiguiendo uno de los principales objetivos del club: el ascenso a Segunda en la temporada 1994-95. Esto supuso convertirse en el equipo más joven en participar en la LFP.